MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori UM032

Total Repeats: 33403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021215	GC	3	6	29	34	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021215	GAAT	2	8	72	79	50 %	25 %	25 %	0 %	529973486
3	NC_021215	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	529973486
4	NC_021215	CTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973486
5	NC_021215	CAAT	2	8	223	230	50 %	25 %	0 %	25 %	529973486
6	NC_021215	GAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973486
7	NC_021215	TTA	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973486
8	NC_021215	GGT	2	6	293	298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973487
9	NC_021215	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
10	NC_021215	GAA	2	6	351	356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
11	NC_021215	TAT	2	6	366	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973487
12	NC_021215	A	7	7	420	426	100 %	0 %	0 %	0 %	529973487
13	NC_021215	AGA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
14	NC_021215	TCT	2	6	487	492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973487
15	NC_021215	A	6	6	494	499	100 %	0 %	0 %	0 %	529973487
16	NC_021215	AGA	3	9	560	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973487
17	NC_021215	A	8	8	667	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021215	CAT	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529973488
19	NC_021215	T	6	6	706	711	0 %	100 %	0 %	0 %	529973488
20	NC_021215	AGA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973488
21	NC_021215	T	6	6	815	820	0 %	100 %	0 %	0 %	529973488
22	NC_021215	CAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529973489
23	NC_021215	C	7	7	968	974	0 %	0 %	0 %	100 %	529973489
24	NC_021215	ATT	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021215	A	7	7	1072	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021215	TTA	2	6	1112	1117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021215	TGG	3	9	1170	1178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021215	AAAG	2	8	1193	1200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021215	T	6	6	1246	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021215	TGA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021215	TGA	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021215	TTG	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021215	A	6	6	1364	1369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021215	CTT	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021215	GATT	2	8	1416	1423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021215	T	7	7	1426	1432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021215	T	7	7	1548	1554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021215	TGA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021215	GGT	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021215	CGCT	2	8	1694	1701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021215	CGA	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021215	TGC	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021215	GAA	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021215	AGCG	2	8	1927	1934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021215	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021215	TCA	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021215	TTTG	2	8	2091	2098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021215	TCA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021215	TGG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021215	GGGCT	2	10	2193	2202	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021215	CGAG	2	8	2256	2263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021215	TATT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021215	TTA	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021215	ACG	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499081269
55	NC_021215	GTT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081269
56	NC_021215	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
57	NC_021215	T	6	6	2493	2498	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
58	NC_021215	CAA	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
59	NC_021215	A	7	7	2525	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	499081269
60	NC_021215	T	7	7	2622	2628	0 %	100 %	0 %	0 %	499081269
61	NC_021215	ACC	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081269
62	NC_021215	TA	3	6	2674	2679	50 %	50 %	0 %	0 %	499081269
63	NC_021215	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499081269
64	NC_021215	GTG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081269
65	NC_021215	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081269
66	NC_021215	T	6	6	2727	2732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021215	GC	3	6	2758	2763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021215	CTT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021215	G	8	8	2842	2849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021215	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021215	AGATGA	2	12	2999	3010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021215	A	7	7	3015	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021215	A	6	6	3070	3075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021215	TTTGG	2	10	3181	3190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021215	AGA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021215	AGA	3	9	3258	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021215	GAT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021215	GAA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021215	GTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021215	G	6	6	3408	3413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021215	GTG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021215	AAC	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021215	GGT	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021215	GTT	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021215	TGG	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021215	G	6	6	3634	3639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021215	AGCG	2	8	3675	3682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021215	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021215	TTA	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021215	TG	3	6	3865	3870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021215	T	7	7	3887	3893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021215	AG	3	6	4009	4014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021215	AG	3	6	4021	4026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021215	CTT	2	6	4100	4105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021215	TTA	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021215	TAT	2	6	4191	4196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021215	TTTGG	2	10	4271	4280	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021215	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
99	NC_021215	CAAA	2	8	4319	4326	75 %	0 %	0 %	25 %	529973390
100	NC_021215	T	6	6	4410	4415	0 %	100 %	0 %	0 %	529973390
101	NC_021215	GATT	2	8	4433	4440	25 %	50 %	25 %	0 %	529973390
102	NC_021215	G	7	7	4445	4451	0 %	0 %	100 %	0 %	529973390
103	NC_021215	AAG	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
104	NC_021215	AAG	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
105	NC_021215	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529973390
106	NC_021215	GCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529973390
107	NC_021215	GAAA	2	8	4706	4713	75 %	0 %	25 %	0 %	529973390
108	NC_021215	AGCG	2	8	4793	4800	25 %	0 %	50 %	25 %	529973390
109	NC_021215	ATG	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529973390
110	NC_021215	ATT	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
111	NC_021215	AGAGA	2	10	4944	4953	60 %	0 %	40 %	0 %	529973390
112	NC_021215	CT	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	529973390
113	NC_021215	A	6	6	4963	4968	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
114	NC_021215	CTT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529973390
115	NC_021215	T	6	6	5046	5051	0 %	100 %	0 %	0 %	529973390
116	NC_021215	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529973390
117	NC_021215	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529973390
118	NC_021215	TTG	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529973390
119	NC_021215	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
120	NC_021215	AGAA	2	8	5236	5243	75 %	0 %	25 %	0 %	529973390
121	NC_021215	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	529973390
122	NC_021215	GGGTC	2	10	5297	5306	0 %	20 %	60 %	20 %	499081265
123	NC_021215	ACC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081265
124	NC_021215	GGT	2	6	5372	5377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081265
125	NC_021215	GTT	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081265
126	NC_021215	GT	3	6	5430	5435	0 %	50 %	50 %	0 %	499081265
127	NC_021215	AAT	2	6	5520	5525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499081265
128	NC_021215	GTTG	2	8	5591	5598	0 %	50 %	50 %	0 %	499081265
129	NC_021215	A	8	8	5656	5663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021215	TGG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021215	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021215	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021215	TTA	2	6	5816	5821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021215	TTTTCT	2	12	5973	5984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_021215	ATT	2	6	6196	6201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021215	GAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021215	A	8	8	6286	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021215	TGA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021215	TAG	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021215	AAG	2	6	6479	6484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021215	GAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021215	AAAGAG	2	12	6521	6532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021215	A	6	6	6541	6546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021215	A	6	6	6590	6595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021215	TG	3	6	6600	6605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021215	AGA	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021215	A	6	6	6765	6770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021215	AG	3	6	6808	6813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_021215	A	6	6	7399	7404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021215	TGC	2	6	7440	7445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_021215	A	6	6	12980	12985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_021215	GTG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_021215	T	6	6	13512	13517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021215	CTA	2	6	13557	13562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_021215	TTA	2	6	13565	13570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021215	GCGA	2	8	13646	13653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_021215	A	8	8	13653	13660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021215	TGAT	2	8	13690	13697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021215	GTG	3	9	13752	13760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021215	AAG	2	6	13792	13797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021215	T	6	6	13826	13831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021215	CT	3	6	13875	13880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
299	NC_021215	CAGA	2	8	13918	13925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
300	NC_021215	T	6	6	13940	13945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_021215	T	6	6	14011	14016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_021215	AGA	2	6	14063	14068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_021215	GAA	2	6	14127	14132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_021215	AGAA	2	8	14839	14846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_021215	CAG	2	6	19570	19575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_021215	TGT	2	6	19838	19843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081253
426	NC_021215	GC	3	6	19850	19855	0 %	0 %	50 %	50 %	499081253
427	NC_021215	CAC	2	6	19947	19952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081253
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429	NC_021215	TGGA	2	8	19989	19996	25 %	25 %	50 %	0 %	499081253
430	NC_021215	TTGGGG	2	12	20014	20025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499081253
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439	NC_021215	TTC	2	6	20637	20642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
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441	NC_021215	T	6	6	20853	20858	0 %	100 %	0 %	0 %	499081253
442	NC_021215	TTC	2	6	20883	20888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081253
443	NC_021215	CGC	2	6	20951	20956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499081253
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449	NC_021215	T	6	6	21342	21347	0 %	100 %	0 %	0 %	499081253
450	NC_021215	CCA	2	6	21353	21358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499081253
451	NC_021215	A	7	7	21361	21367	100 %	0 %	0 %	0 %	499081253
452	NC_021215	CAA	2	6	21378	21383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499081253
453	NC_021215	TAT	2	6	21464	21469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499081253
454	NC_021215	CAA	2	6	21566	21571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_021215	CT	3	6	21578	21583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_021215	A	6	6	21623	21628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_021215	TTG	2	6	21672	21677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081252
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460	NC_021215	TTC	2	6	21878	21883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499081252
461	NC_021215	TGT	2	6	21895	21900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499081252
462	NC_021215	CCT	2	6	21963	21968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
463	NC_021215	T	6	6	21976	21981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021215	ATTC	2	8	22008	22015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_021215	TAC	2	6	22041	22046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_021215	TTG	2	6	22072	22077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_021215	ACC	2	6	22195	22200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529973391
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485	NC_021215	A	7	7	23047	23053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_021215	TCA	2	6	23077	23082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
487	NC_021215	A	6	6	23082	23087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_021215	CGAT	2	8	23090	23097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_021215	A	7	7	23188	23194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_021215	T	7	7	23232	23238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_021215	T	8	8	23254	23261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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